| 国立研究開発法人 国立がん研究センター中央病院 | 地域がん診療連携拠点病院 2023年4月～ |
| 小児がん中央機関 |
| 学校法人 聖路加国際大学 聖路加国際病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 国家公務員共済組合連合会 虎の門病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 東京慈恵会医科大学附属病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 順天堂大学医学部附属順天堂医院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 国立大学法人 東京医科歯科大学東京医科歯科大学病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 日本医科大学付属病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 東京大学医学部附属病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 地方独立行政法人 東京都立病院機構 東京都立駒込病院 | 都道府県がん診療連携拠点病院 |
| 東京女子医科大学附属足立医療センター | 地域がん診療病院 |
| 地方独立行政法人 東京都立病院機構 東京都立墨東病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| がん研究会有明病院 | 都道府県がん診療連携拠点病院 |
| ＮＴＴ東日本関東病院 | 地域がん診療連携拠点病院（高度型） 2023年3月 削除 |
| 地域がん診療連携拠点病院 2023年4月～ |
| 学校法人 昭和大学 昭和大学病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 東邦大学医療センター大森病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 日本赤十字社医療センター | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 独立行政法人 国立病院機構 東京医療センター | 地域がん診療連携拠点病院（高度型） 2023年3月 削除 |
| 地域がん診療連携拠点病院 2023年4月～ |
| 国立成育医療研究センター | 小児がん拠点病院 |
| 小児がん中央機関 |
| 東京医科大学病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 慶應義塾大学病院 | 地域がん診療連携拠点病院（高度型） 2023年3月 削除 |
| 地域がん診療連携拠点病院 2023年4月～ |
| 国立研究開発法人 国立国際医療研究センター病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 帝京大学医学部附属病院 | 地域がん診療連携拠点病院（高度型） 2023年3月 削除 |
| 地域がん診療連携拠点病院 2023年4月～ |
| 日本大学医学部附属 板橋病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 日本赤十字社 武蔵野赤十字病院 | 地域がん診療連携拠点病院（高度型） 2023年3月 削除 |
| 地域がん診療連携拠点病院 2023年4月～ |
| 杏林大学医学部付属病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 地方独立行政法人 東京都立病院機構 東京都立多摩総合医療センター | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 地方独立行政法人 東京都立病院機構 東京都立小児総合医療センター | 小児がん拠点病院 |
| 公立 昭和病院 | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 独立行政法人国立病院機構災害医療センター | 地域がん診療連携拠点病院 |
| 東海大学医学部付属八王子病院 | 地域がん診療連携拠点病院（特例型） 2021年8月～2022年3月 削除 |
| 地域がん診療連携拠点病院 2022年4月～ |
| 東京医科大学八王子医療センター | 地域がん診療連携拠点病院（特例型） 2021年3月 削除 |
| 地域がん診療連携拠点病院 2021年4月～ |
| 市立青梅総合医療センター | 地域がん診療連携拠点病院 |
